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體委會功成身退併入教育部成為體育署，首任署長何卓飛過去曾任體育司長、高教司長與參事，上任不到一小時已經決定儘快舉行體育論壇，研議體育政策白皮書，還要想辦法連結學生運動與競技運動。
面對2013年天津東亞運以及2014年仁川亞運，何卓飛還不敢承諾奪牌數，只是體育署2013年預算48億，僅占教育部2100億總預算的40分之1，如何兼顧全民、競技與學生運動？將讓他大傷腦筋！
同時走馬上任的還有國民及學前教育署首任署長吳清山，這個整併了國教司、中教司與中部辦公室的單位，最重要的工作就是2014年實施的12年國教。
而併入教育部的青輔會也成為青年發展署，只是原本屬意的署長人選臨時拒絕，由次長陳德華暫代。未來教育部不只著力各年齡層教育，還要想辦法解決產學失衡與青年失業率的問題，總統馬英九也才會強調，台灣未來的競爭力，教育部責任重大。
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