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現代醫學對於黑木耳有許多研究，學者發現黑木耳含有特殊的膠質，有點類似活性碳那樣，可以吸附一些雜質異物，讓這些不好的東西排出體外，如果擔心工作環境或日常生活週遭毒素比較多，就可以試著吃一點木耳，簡單來講就是幫助排毒。也有研究證實黑木耳具有抗凝血作用，想預防血管阻塞，預防心血管疾病的話，也可以試試黑木耳。
另外，研究人員也發現，黑木耳含有大量的多醣體，它可以調節免疫系統，增強我們的抵抗力，這就跟中醫的看法相符，因為中醫認定黑木耳是「黑色食物」，黑色食物有「補腎」效果，也就是促進泌尿系統和免疫系統的正常運作。中醫還認為木耳有潤腸的效果，如果有便祕問題，可是不想用太過強烈的清瀉藥物來處理，就可以嘗試吃木耳來幫助排便。
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